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Title
한미 BIT 융합 통합분석시스템(Bioworks) 서버 클러스터 개발 및 글로벌 활용체제 구축
Alternative Title
International Collaboration for Global Bioworks Service on TACC HPC Systems
Author(s)
이상주이상주한영만안인성이준학
Alternative Author(s)
Lee, Sang-Ju; Lee, Sang-Ju; Han, Yeong-Man; An, In-Seong; Lee, Jun-Hak
Publisher
한국과학기술정보연구원
Korea Institute of Science and Technology Information
Publication Year
2010-12
Description
funder : 교육과학기술부
agency : 교육과학기술부
Abstract
○ TACC 슈퍼컴퓨팅 기반 Bioworks 시스템 구축과 KISTI-TACC Bioworks 서버 클러스터 구축
- TACC Ranger 시스템에 Bioworks 전용 서비스 노드(helix) 도입 및 Bioworks 서버 클러스터 구축
- Bioworks 서버 클러스터와 TACC LDAP 서버 연계를 통해 TeraGrid 사용자가 바로 Bioworks 서비스를 사용할 수 있도록 구현
- REST 기반 서버 푸쉬 방식의 Ranger SGE 배치큐 연계 모듈 개발 및 적용을 통해 Large-scale analysis 를 위해 가장 중요한 parallel simulation 을 위한 기반 기술 구현
- Bioworks 클라이언트 프로그램 커스터마이징 및 UI 테스트
○ Bioworks 서버 클러스터 기반 생명정보 분석 도구 통합 및 국제 수준 생명정보 분석 시나리오 구축
- Ranger 슈퍼컴퓨터에 유전체 데이터 분석을 위한 주요 응용프로그램 모듈 설치(BLAST+, mpiBLAST, HMMER 등)
- 최근 BIT 융합 분야에서 각광받고 있는 대용량 NGS(Next Generation Sequence) 데이터의 assembly, analysis, visualization에 초점을 맞추어 국제 수준의 생명정보 분석 워크플로우 구현
○ TACC 슈퍼컴퓨팅 기반 Bioworks 시스템 서비스를 통한 국제 수준 해외 사용자 그룹 유치 및 활용 워크플로우 시나리오 확보
- TACC Bioworks 영문 포털 사이트 공식 오픈
- University of Texas at Austin의 생명정보 연구 그룹 확보 및 시범 서비스 진행
- 미국 내 국제 수준의 생명정보 연구그룹을 유치 수행, 대상 그룹은 Pacific Northwest National Lab, MD Anderson Cancer Center, Johns Hopkins University 등.
○ 슈퍼컴퓨팅 기반 BIT 융합 연구 지원을 위한 국제 수준의 KISTI 자체 핵심 기술 보유할 수 있고 KISTI에서 개발한 시스템을 세계적인 슈퍼컴퓨팅 인프라 위에 구축하고 해외 우수 연구 그룹에 서비스함으로써 KISTI의 국제적 위상을 한층 더 제고

○ Development of KISTI-TACC Bioworks Server Cluster
- Support of Bioworks sever-cluster system deployment on TACC Ranger system
- Develop Ranger-specific software technology for Bioworks configuration
- Integrate selected computational biology applications on Ranger into Bioworks platform
○ Global Bioworks Service on KISTI-TACC Bioworks Server Cluster
- Introduce Bioworks service to high-profile research groups at UT
- Test drive prototype of Bioworks service on Ranger system
- Use experiment metrics to develop advanced workflow scenarios
- Integrate larger number of applications into Bioworks service
- Develop a series of advanced workflow scenarios by UT research groups
- Add more friendly CompBio user groups
Keyword
가상세포; 바이오인포매틱스; 생명정보; 슈퍼컴퓨팅; 워크플로우; 국제협력; Virtual Cell; BIT; Bioinformatics; Super Computing; Workflow; TACC; TeraGrid
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Appears in Collections:
7. KISTI 연구성과 > 연구보고서 > 2010
URI
https://repository.kisti.re.kr/handle/10580/11033
http://www.ndsl.kr/ndsl/search/detail/report/reportSearchResultDetail.do?cn=TRKO201100007997
Fulltext
 http://www.ndsl.kr/ndsl/commons/util/ndslOriginalView.do?dbt=TRKO&cn=TRKO201100007997
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