한미 BIT 융합 통합분석시스템(Bioworks) 서버 클러스터 개발 및 글로벌 활용체제 구축

Abstract

○ TACC 슈퍼컴퓨팅 기반 Bioworks 시스템 구축과 KISTI-TACC Bioworks 서버 클러스터 구축 - TACC Ranger 시스템에 Bioworks 전용 서비스 노드(helix) 도입 및 Bioworks 서버 클러스터 구축 - Bioworks 서버 클러스터와 TACC LDAP 서버 연계를 통해 TeraGrid 사용자가 바로 Bioworks 서비스를 사용할 수 있도록 구현 - REST 기반 서버 푸쉬 방식의 Ranger SGE 배치큐 연계 모듈 개발 및 적용을 통해 Large-scale analysis 를 위해 가장 중요한 parallel simulation 을 위한 기반 기술 구현 - Bioworks 클라이언트 프로그램 커스터마이징 및 UI 테스트 ○ Bioworks 서버 클러스터 기반 생명정보 분석 도구 통합 및 국제 수준 생명정보 분석 시나리오 구축 - Ranger 슈퍼컴퓨터에 유전체 데이터 분석을 위한 주요 응용프로그램 모듈 설치(BLAST+, mpiBLAST, HMMER 등) - 최근 BIT 융합 분야에서 각광받고 있는 대용량 NGS(Next Generation Sequence) 데이터의 assembly, analysis, visualization에 초점을 맞추어 국제 수준의 생명정보 분석 워크플로우 구현 ○ TACC 슈퍼컴퓨팅 기반 Bioworks 시스템 서비스를 통한 국제 수준 해외 사용자 그룹 유치 및 활용 워크플로우 시나리오 확보 - TACC Bioworks 영문 포털 사이트 공식 오픈 - University of Texas at Austin의 생명정보 연구 그룹 확보 및 시범 서비스 진행 - 미국 내 국제 수준의 생명정보 연구그룹을 유치 수행, 대상 그룹은 Pacific Northwest National Lab, MD Anderson Cancer Center, Johns Hopkins University 등. ○ 슈퍼컴퓨팅 기반 BIT 융합 연구 지원을 위한 국제 수준의 KISTI 자체 핵심 기술 보유할 수 있고 KISTI에서 개발한 시스템을 세계적인 슈퍼컴퓨팅 인프라 위에 구축하고 해외 우수 연구 그룹에 서비스함으로써 KISTI의 국제적 위상을 한층 더 제고

○ Development of KISTI-TACC Bioworks Server Cluster - Support of Bioworks sever-cluster system deployment on TACC Ranger system - Develop Ranger-specific software technology for Bioworks configuration - Integrate selected computational biology applications on Ranger into Bioworks platform ○ Global Bioworks Service on KISTI-TACC Bioworks Server Cluster - Introduce Bioworks service to high-profile research groups at UT - Test drive prototype of Bioworks service on Ranger system - Use experiment metrics to develop advanced workflow scenarios - Integrate larger number of applications into Bioworks service - Develop a series of advanced workflow scenarios by UT research groups - Add more friendly CompBio user groups