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Title
PIF1-interacting transcription factors and their binding sequence elements determine the in vivo targeting sites of PIF1
Author(s)
강효진최길주김우현김재욱김정현박정무유장현윤태영이나영
Publication Year
2016-06-14
Abstract
The bHLH transcription factor PHYTOCHROME INTERACTING FACTOR1 (PIF1) binds G-box elements in vitro and inhibits light-dependent germination in Arabidopsis thaliana. A previous genome-wide analysis of PIF1 targeting indicated that PIF1 binds 748 sites in imbibed seeds, only 59% of which possess G-box elements. This suggests the G-box is not the sole determinant of PIF1 targeting. The targeting of PIF1 to specific sites could be stabilized by PIF1-interacting transcription factors (PTFs) that bind other nearby sequence elements. Here, we report PIF1 targeting sites are enriched with not only G-boxes but also with other hexameric sequence elements we named G-box coupling elements (GCEs). One of these GCEs possesses an ACGT core and serves as a binding site for group A bZIP transcription factors, including ABSCISIC ACID INSENSITIVE5 (ABI5), which inhibits seed germination in abscisic acid signaling. PIF1 interacts with ABI5 and other group A bZIP transcription factors and together they target a subset of PIF1 binding sites in vivo. In vitro single-molecule fluorescence imaging confirms that ABI5 facilitates PIF1 binding to DNA fragments possessing multiple G-boxes or the GCE alone. Thus, we show in vivo PIF1 targeting to specific binding sites is determined by its interaction with PTFs and their binding to GCEs.
Keyword
transcription factor; PIF1; G-box; binding specificity
Journal Title
Plant Cell
Citation Volume
28
ISSN
1040-4651
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7. KISTI 연구성과 > 학술지 발표논문
URI
https://repository.kisti.re.kr/handle/10580/14517
http://www.ndsl.kr/ndsl/search/detail/article/articleSearchResultDetail.do?cn=NART75971060
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