국가슈퍼컴퓨팅공동활용체제의 슈퍼클러스터 기반구축 부제: KISTI-KIST-SNU 간 슈퍼클러스터 구축

Abstract

슈퍼컴퓨터자원 공동활용 체제 구축을 위한 표준권고안 작성 - 슈퍼컴퓨터급 클러스터의 구성인자 분류 - 분류된 구성 인자들의 특성 조사 - 각 구성 인자들의 조합과 성능을 분석하여 최적안 제시 - 최적안을 반영한 표준권고안 작성 슈퍼컴퓨터자원 공동활용 체제 구축을 위한 클러스터 구축 - 표준권고안을 바탕으로 추후 계속될 공동 활용체제를 위한 클러스터 구축 - 나노 및 바이오 특화 슈퍼클러스터링 환경 구축 슈퍼컴퓨터자원 공동활용 환경에서의 대형 프로그램 시연 - 슈퍼컴퓨팅 자원 공동 활용 필요성 입증을 위함 - Single Wall Carbon Nanotube 의 Sonification 연구 - Protein Folding 연구, DNA-RAM 활용을 위한 전기 전도도 연구 등의 바이오 연구 가시화 연동 환경 구축 - 8진트리(Octree)를 이용한 공간 분할 및 검색 라이브러리 개발 - 초기 가시성 측정을 위한 차단차폐(Occlusion Culling) 기법의 개발 - 가시화 프로그램 개발·등록 및 시현

Ⅲ. Result of the study ● Development of recommended cluster specification for PLSI - Classification of main devices of super-computing cluster system - Investigation of characteristics of each devices - Benchmark test of each devices - Selection of each devices and decide the recommended cluster specification ● Development of linux cluster for the use of PLSI - Linux cluster development for the use of PLSI - Installation of libraries and programs for the use of nano-bio researches - Construction of GFS (Global File System) ● Calculation of many-atom system - Research of sonification mechanism of single wall carbon nanotubes - Research of protein folding, calculation of DNA conductivity, etc. ● Development of parallelized visualization system - Development of space partitioning and searching library using octree - Development of occlusing culling method - Development of visualization program