개인진단을 위한 유전자 증폭 방법과 제품 개발

Abstract

개인이 가정에서 진단을 수행할 수 있는 등온증폭 기술의 개발을 위해서 본 연구에서는 기존의 루프매개 등온증폭법(Loop-mediated isothermal amplification assay, 이하 LAMP)의 한계점인 등온 증폭용 프라이머의 성능 저하 등 문제점을 해결하기 위해서 CRISPER-CAS9을 기반으로 하는 새로운 등온증폭 방법을 제안하였다. 새롭게 개발된 방법은 4단계의 다중 증폭과정이 연계되어 더욱 빠르게 등온조건에서 해당 유전자를 증폭할 수 있을 것으로 기대된다. 이러한 실험방법을 실제 제품으로 설계하기 위해서 본 연구에서는 기존에 보고된 다양한 질병을 유발하는 미생물의 염기서열을 기반으로 다중서열 분석을 수행한 후 이를 작은 블록 단위로 조각 내에 프라이머 설계의 적합성을 확인할 수 있는 설계방법을 개발하였다. 개발된 프로그램의 정확도를 검증하기 위해서 결핵을 대상으로 LAMP 프라이머 설계를 수행했으며, 이를 통해 실제 기존 제품의 프라이머보다 정확성이 높음을 확인하였다.

(출처 : 보고서 초록 5p)

Ⅳ Results of the study ○ Development of primer design software for gene amplification - Development of gene amplification search method based on multiple sequence alignment - Development of entropy-based target sorting technology - Primer pair selection and isothermal amplification simulation technology for isothermal amplification - Primer design for Mycobacterium tuberculosis

○ Establishment of reagent and reaction conditions and product development for isothermal gene amplification - Search for experimental conditions for isothermal amplification - Experimental design of LAMP for Mycobacterium tuberculosis and experiment of amplification condition - Gene amplification experiments and establishment of optimal conditions for four types of tuberculosis-specific genes

(출처 : SUMMARY 10p)