IT기반 바이오인포매틱스 인프라 구축 및 응용연구

Abstract

생명정보데이터 및 도구통합시스템 구축 ○ 다양한 종류의 생물정보 데이터를 저장하기 위한 관계형 데이터베이스 시스템 구축 ○ 대용량의 생물정보에 대한 검색 고속화를 위한 검색엔진 도입 ○ 검색결과에 대한 다양한 사용자 화면 제공 ○ 현재 110개의 생물정보 데이터베이스 통합 및 서비스 ○ 각종 바이오인포매틱스 분석도구에 대한 통합 ○ 분석의 고속화를 위한 배치큐 시스템과의 연동으로 슈퍼컴퓨터 활용 ○ 현재 100개의 분석도구 통합 및 서비스 ○ 다양한 생명과학분야의 분석을 연계적으로 자동 수행하기위한 워크플로우 개발 ○ 사용자 자료 저장 관리용 데이터베이스 구축 ○ 사용자 자료 접근권한 (ACL) 개발 ○ 고급사용자를 위한 클라이언트 프로그램 개발 및 서비스 ○ 여러 사이트의 정보를 검색 및 분석도구 실행할 수 있는 IBS네트워크 시스템 개발 생명과학 문헌정보 네트워크(BioInfoNet) 시스템 구축 ○ 국내 생명과학 관련 문헌조사 및 연구자 요구사항 조사 ○ 생명과학 문헌정보 네트워크 프로토타입 설계 및 개발 ○ KISTI 학회마을, DOAJ 등 국내외 관련사이트 조사 분석 ○ Open Archiving Community모듈, Open Acess Service모듈, 관리자 모듈 설계 구현 ○ Open Archiving Community구성을 위한 이용자 요구조사를 통한 홍보실시 ○ 생명과학 문헌정보 네트워크 시스템 구축 및 서비스

(1) Development of integrated bioinformatics system ○ Design and construction of integrated database for biological data - Investigation and understanding of existing integrated database - Design of integrated database for biological data - Analysis of data and development of the data input program ○ Implementation of search engine to improve searching speed in the constructed biological database. - Indexing of massive biological data - Development of data migration program from RDB to the search engine - Development of user interface between user and the search engine ○ Development of web interface - Development of web interface using high information technology in IT field(Spring, JSF)