웹 기반 단백질 상호작용 예측 서비스 시스템 구축

Abstract

본 위탁 연구는 단백질 기능 추정에 관심 있는 생물학자 및 신약 개발자에게 유용한 단백질 상호작용에 관한 정보를 실험이 아닌 계산적 방법에 의해 예측한 뒤 대량으로 제공하기 위하여 시작되었다. 이를 위해 본 연구에서는 인터넷상에 공개된 단백질 상호작용 데이터로부터 도메인 및 도메인 조합 간 상호 작용에 관해서 추론하는 방식을 고안하고 그 결과를 웹상에서 공개 서비스함으로써 저비용으로 다량의 단백질 상호작용 예측을 가능케 해 이 분야 연구의 국가 경쟁력을 제고하고자 하였다. 계산을 통한 단백질 상호작용 예측 기법의 중요성이 제기되면서 많은 단백질 상호 작용 예측 기법이 제안되고 있다 . 하지만 이러한 기법들이 일반 사용자가 손쉽게 사용할 수 있는 서비스 형태로 제공되고 있는 경우는 드물다 . 본 과제에서는 현재까지 알려진 단백질 상호작용 예측 기법 중 예측 기법의 완성도가 높고 상대적으로 예측 정확도가 높은 것으로 알려진 도메인 조합 기반 단백질 상호작용 예측 기법을 Pre SPI ( Pre di c t i on Sys t em f or Pro t e i n I nt e rac t i on) 라는 서비스 시스템으로 설계하고 구현하였다 . 구현된 시스템이 제공하는 기능은 크게