생물분자들에 대한 전산시늉을 위한 알고리즘에 대한 연구

Abstract

III. 연구개발의 내용 및 범위 분자배열공간상에서 떨어져있는 영역들을 탐사하는데 MES를 효과적으로 적용할 수 있는 체계적이면서도 일반적인 실행 방법론을 도출해 내기 위한 작업을 수행한다. 이 작업에서는 좀 더 일반화시킨 MES의 무게함수의 꼴을 이용하며, ‘물 속에서의 공동 형성’을 몬테카를로(MC)로 수행하여, 시늉내기 매개변수들과 계산의 효율성과의 상관관계를 조사하고 그 결과로부터 효율성을 극대화할 수 있는 체계적인 실행방법을 제시한다.

III. Content and scope of the study Works for finding out practical systematic ways of using the MES efficiently to explore distantly separated regions in configuration space are performed. In this work, the more generalized weighting function for MES is used and ` cavity formation in water"" is simulated using Monte Carlo. Investigating the correlation of simulation parameters and the efficiency of the method, we propose a practical way of maximizing the power of the MES.